Je ne peux rien dire sur tes chances d'être pris dans la mesure où je ne connais pas les critères exacts de recrutement dans tel et tel lycée, mais si tu avais 10 et que tu as fini avec une mention bien... c'est plutôt un avantage d'avoir attendu un an (si tu avais fait le dossier en terminale, avant de prouver que tu pouvais avoir 14 ou 15 à l'examen, ça aurait été plus dur !) En plus, tes notes de bac peuvent montrer que tu es sur une dynamique de progression.
Ensuite, même si tu n'es pas pris, ça sera dommage, mais toujours moins que de n'avoir pas essayé : tu n'aurais pas de regret à avoir, et tu pourras te concentrer sur le 2e concours sereinement !
Pour la fiche, aucune idée... C'est formulé comment ? Sinon, dans le doute, essaie de faire un peu des deux, en sélectionnant les profs de lycée et de fac (voire profs de TD, qui te connaissent mieux) susceptibles de te mettre les appréciations les plus "sympas" !
Peut-être aussi un relevé de notes de partiels ? S'ils n'en donnent pas automatiquement pour le premier semestre, tu peux toujours demander à l'Ufr en disant que c'est pour un dossier. Ou sinon, faire marquer ça sur la feuille d'avis avec tampon de l'Ufr ou signature des profs.
Je ne sais pas s'il faut faire une lettre de motivation, mais si oui, tu peux insister sur la maturité que t'a donné une année à la fac après ton bac : une expérience réussie des études approfondies en histoire qui ont développé ton goût pour cette matière et donc un projet vraiment réfléchi et mûri de tenter le concours de l'école des Chartes (que n'a pas forcément un élève de terminale, mais ça reste sous-entendu, ne le mets pas comme ça ; tu peux aussi dire que cette année t'a permis de découvrir de façon plus approfondie l'histoire ancienne, médiévale et moderne, alors que les classes de 1ère et de Terminale se concentrent sur l'histoire contemporaine, donc vraiment, ton projet est informé et réfléchi !) ; une autonomie dans ton travail qui t'a permis de développer des méthodes de travail efficaces que tu voudrais malgré tout perfectionner en classe préparatoire où, tu en es conscient, la charge de travail sera plus intense ; d'ailleurs, tu te réjouis d'avoir plus de travail, car cette année d'histoire à l'université t'a fait prendre conscience du fait que, pour être bien maîtrisée et replacée dans son contexte, l'étude de l'histoire devait s'accompagner d'une formation plus généraliste en lettres et en langues (par exemple, connaître la littérature de la période historique étudiée permet une meilleure prise en compte du contexte culturel et offre un nouveau type de sources), que l'université ne peut t'apporter aussi bien que la prépa où toutes les matières sont importantes (pour qu'ils ne pensent pas que tu vas bosser en histoire et glander en français, en gros).
--> En bref : ce n'est pas un handicap d'avoir attendu un an avant de faire une candidature car ton année à la fac t'a beaucoup apporté en maturité (développement d'un projet d'études, voire professionnel), mais le cursus pluridisciplinaire de la prépa t'apparaît indispendable pour accomplir tes projets en histoire dans les meilleures conditions (de façon matérielle, pour passer le concours de l'école des Chartes ; d'un point de vue intellectuel pour disposer d'outils de compréhension et de réflexion complémentaires à l'histoire, comme la littérature ou les langues).
D'ailleurs, même si la lettre de motivation n'est pas expressément demandée, comme tu es dans un cas particulier, cela se justifierait tout à fait d'en joindre une, pour montrer que cette candidature n'est pas une lubie et qu'elle est parfaitement réfléchie. Si c'est argumenté, ça montre une maturité qui joue beaucoup en ta faveur et retourne facilement l'éventuel "handicap" que pourrait être une candidature tardive.
Bon courage !